截至目前，保存在甘肃省各级国家档案馆的清朝档案总计有8218卷，1559件，而保存于甘肃省档案馆的2490卷（件）清王朝档案，从康熙四十四年（1705年）至宣统三年（1911年）为止，时间跨度206年，涵盖了清王朝时期甘肃地方政府（包括今宁夏、西宁）档案。这些档案不仅反映了清代甘肃的历史状况，且广泛地涉及整个西北地区，内涵极为丰富，对于研究和考评清末甘肃及整个西北地区的政治、经济、军事、文化、社会、教育等诸方面的历史都具有很高的史料价值。
　　兰州是陕甘总督、甘肃省布政司、按察司、提学司驻地，原存文书档案相当丰富。由于1913年甘肃财政司司长田骏丰借故将十数屋明清档案焚烧一空，毁档灭史，使甘肃历史档案损失惨重，故现存为数不多的清代档案，尤为珍贵。清代档案的载体样式，绝大部分为清册式，一小部分为零纸式，也有少许系由原档汇抄而成的写本。就其来源看，现存原档大部为官文书，小部为从民间收集的私人文书。这批清代官文书，卷帙浩繁，涉及地域广阔，立档单位众多，大都直接产生于甘肃全省乃至大西北各地各级政务、兵戎、财经和文教机构。从许多现存奏销清册扉页上钤盖有"中国长春铁路公司中央图书馆”印，"旅大市图书馆藏书印”和"南满洲铁道株式会社大连图书馆”印等印文来看民国时期甘肃省档案馆馆藏的占很大比重，奏销清册类档案曾一度从甘肃流落到东北地区。从上述第三枚印章的中心部位镌刻有"昭·1951”的字样分析，显然是日本昭和年号的缩写语，足以说明这批档案还曾蒙受侵华日本占领者的文化统治。解放后，才由有关方面移送阔别多年的甘肃故土，由甘肃省档案馆接收典藏至今。在清代档案中，除了从民间收集的部分零星档案，因年代久远，不同程度地发生纸质变黄、发脆或破损，甘肃省档案馆进行了及时抢救托裱以外，其余大部档案均仍维持原状。这些档案，纸质尚好，字迹清晰，残损程度较轻微，内容较为完整，基本上保持了历史原貌。

　　甘肃全省清代档案的涵盖面相当广泛，内容相当丰富。大致说来，可划分为七大方面：
　　一是各级政务机构档案，包括陕甘总督部堂和甘肃巡抚衙门收支款项报告册。甘肃布政司造报各属俸饷细数，养廉银两；兰州、平凉、巩昌、庆阳、凉州、宁夏、西宁七府留支驿站款项，各官车局书役口
食，骡脚车价，杂差银两；各厅州县仓谷动用情况，仓储征耗，米粮时估价值，赈抚粮石，额征地丁银粮考成，民欠地丁正耗粮草已未完数目，捐输等则及承纳税银，牙(帖)、磨(户)税课清册、报告册和奏销册等。
　　二是各级监察和司法机构档案，包括甘肃提法司(由按察司改名)录造所属裁留员额工料价银，倒马差员廪口等银；各道铺司汛、驿站军塘出入款项；各道府州县刑钱事实，监解各犯口粮钱文并盐菜银
两报告册。甘肃巡警总局、甘肃审判研究所、甘肃审判筹备处、甘肃戒烟总局清册等。
　　三是各级文化教育和卫生机构档案，包括甘肃提学司入款数目，全省各属额征学租粮石清册。甘肃学务公所、甘肃石印书局、甘肃通志局、甘肃官医局、甘肃高等学堂、甘肃优级师范学堂、省城学堂局、农业商矿学堂、政治学堂、初级师范学堂、陆军小学堂报告册。甘肃官报书局洋匠薪水、机器价值简明总册。
　　四是各级军事机构档案，如甘州、固原二提督挑选练军马队，官兵书识支过杂费银两清册。凉州、河州、肃州、宁夏、西宁五镇实存兵民数目清册。凉州、庄浪、宁夏三满营俸饷等则清册。甘肃军械、子药、机器、火药四局报告册。甘肃陆军财政局，甘肃全省陆军兵备、参谋、教练、统计四处报告清册。各镇、协、标、营所属副将、参将、把总、守备、都司、游击造赍公差银两，买补差防马匹，差乘马匹毛片口齿，经管挑留和添募兵丁，草价银两，鸟枪炮位，军装器械，号衣藤牌，旗帜车炮，行军纪律，疏防案件，赏罚科条，会议条例，籍贯履历，衙署颁布流传敕书，上谕则例，满汉各书报告清册、报告册。甘肃督练公所、甘肃薪饷所、新军督练公所、甘肃平凉军服局、甘肃省城新军步队、营队、马队出入报告分册、结册。

　　五是各级农工财贸机构档案。甘肃藩库实存金银钱确数，田赋杂租，盐茶税厘，外销暂寄，各省协款、交涉款、军行款，旗营、绿营司法费清册。甘肃统捐总局欠还欠解各款，行政费、交涉费、财政费、典礼费、教育费、司法费、军政费、实业费、工程费等支款杂费清册。甘肃各属官盐、黄菸、百货、药材统捐分局报告册。甘肃农工商矿总局地丁耗羡，煤山地租，附设劝工厂各科员司工役人等额支薪工口食暨活支杂项银两清册。甘肃洋务总局造送兰州城内马路用过银两及修理黄河铁桥收支册。甘肃清理财政局、甘肃公支局、甘肃农业内外试验场、甘肃源源仓、甘肃织呢局、甘肃官铁局、甘肃商品陈列所收支清册。
　　六是宁夏、青海、新疆、陕西等邻省事务档案。
　　新疆粮台马步各营旗官衔名及驻扎处所，哨员丁夫数目，东南北三路收支等项，南路电工建修局工程作法，采用物资、银两报销册。新疆各属义学等项经费银两清册。新疆通商善后局薪水等项银两报告清册。新疆防军简明四柱清册。新疆巡抚、伊犁镇、伊犁将军薪饷拨款等项清册。

　　宁夏部郎衙门、宁夏满营四柱清册。宁夏监捕厅出入款项报告册。宁夏仓谷奏销总清册。宁夏镇属各营养廉银两奏销清册。宁夏惠安盐务、花定盐务、花马池盐务报告册。固原提督造报标路各营堡原额实存兵马数目清册。
青海西宁办事大臣四柱清册。青海西宁办事大臣乾字小马队、亲军小马队、各地续备步队、查矿马队、巡防左右旗马队报告分册。青海垦务总局报告册。西宁府各属带征番粮奏销册。西宁官银钱局报告
册。西宁矿务大局造赍支过杂费银细数清册。
　　甘肃百货统捐驻西安局，驻凤翔、略阳、安边分局，甘肃大布兼百货统捐驻三原大局报告册。延安府造赍支过监犯口粮钱文奏销册。署陕西八营移驻瓦亭营守备造报本营汛现存官兵数目清册。陕西省协
甘款报告册。陕西西安城守协副将结册。
　　七是其它档案。甘肃各属水地、川原、山坡种植罂粟地亩应征税银数目清册。署甘肃金塔协造报副将接收江楚会奏变法书籍原案交待册。署甘肃西宁镇属北川营都司造呈接收移交奉到大清国、大英国会议条款清册。甘肃地方大员具奏乾隆皇帝请安折。咸、同、光、宣四朝青海大通县红山堡农民完纳贡仓斗粮的执照；开册额征粮草数目，给发农户，以便遵守缴纳的易知由单；写有户主姓名、年岁、家庭人
口、房屋场院，磨、窑、雇工情况和缴纳粮草数目的门牌；民间草签的房地产契约。
　　《甘肃奏折》写本，记述了武威地区筹办洋务，开设学堂，审讯案件，栽种树木，清查户口，选送习艺学徒，严禁书吏需索，清厘钱粮积欠，调处番汉林木纠纷等内容的各种申、详、禀、示、谕、单、序、折、函件等。尤其是罂粟种植地亩，江楚会奏变法书籍和《甘肃奏折》等，更是难得的珍品。
　　甘肃省档案馆馆藏的清代档案具有很高的史料价值，真实记录了清代社会的政治、军事、经济、文化、金融等各方面的历史状况，是文史研究、志书编纂、文艺创作的宝贵文化遗产。