中央研究院敦煌艺术研究所，前身是1944年2月成立的国立敦煌艺术研究所，1946年改隶中央研究院管辖。

馆藏中央研究院敦煌艺术研究所全宗档案为复制件，共112件，上架排列长度0.8米，起止年代为1921年至1949年。其主要内容有：甘肃省长公署、国立敦煌艺术研究所、教育部、国立敦煌艺术研究所筹委会、国立中央研究院、粮食部、国民政府、行政院、甘肃省民政厅等单位关于机构变更、洞窑修建、请领生活补助费及粮食代金、各项预算、补助标准、人事动态、各项规约等的指令、公函、代电、电报、呈以及西北科学考察团工作计划及岁出概算表、计划大纲，西北史地考察团谈话记录等。